三重脑假说(Triune brain)是一个由美国医生、神经科学家保罗·D·麦克莱恩所提出，用以描述脊椎动物前脑与行为的演化过程的模型。
本能脑(爬虫脑复合区)
本能脑负责物种的典型本能行为。例如，调节心跳、呼吸、血压、血液循环、消化以及战斗或逃跑反应。
现代爬行动物和鸟类也具有这部分脑。人类的这部分脑位于脑干中。
它对我们的生存至关重要，不需要我们思考或感知就能运作。
情绪脑(古哺乳动物脑)
情绪脑产生觅食、生殖与育幼行为的动机与情绪。能产生饥饿、疼痛、困倦、愤怒、恐惧与快乐等。情绪脑的反应也是自动的，而且经常是本能反应。
情绪脑由中膈、杏仁核、下丘脑与海马回组成。这部分也被称为边缘系统。
杏仁核是威胁—响应和威胁—解释系统的控制中心。当动物的杏仁核被故意破坏时，这些动物就丧失了攻击行为，同时也丧失了对恐惧做出正常反应的能力，它们变得无所畏惧。杏仁核功能异常可能与抑郁症、创伤后应激障碍、恐惧症、焦虑症和冲动行为等有关。
海马体是主要的记忆中枢：这些大脑结构在情绪事件发生后被激活，并在记忆巩固的过程中相互“交谈”。由海马体决定短期记忆会被变成长期记忆(存在大脑中)。
情绪脑与多巴胺和内啡肽的释放有关。它影响着习惯的养成和成瘾。
新皮质(新哺乳动物脑)
新皮质的这部分赋予了我们高度的推理能力——进行分析性和逻辑性思考、解决问题、规划未来以及抽象思考的能力。这是大脑中进化程度最高的部分，它调节并努力控制更古老、更原始大脑的冲动。
新皮质组成，这种结构只在高等哺乳类动物，特别是人类身上出现。
前额叶皮质是新皮质的关键组成部分，其复杂性是人类所独有的。它约占大脑总体积的10%，而且正如我们前面提到的，它约占据整个新皮质的1/3。就像首席执行官指挥着众多员工进行业务操作一样，在他的监督下，前额叶皮质努力为传入的信息寻找最佳的可能反应。它使我们能够深思熟虑，而不是立即对情况做出反应，与易做出反应的杏仁核的功能正好相反。
杏仁核和前额叶皮质一直处于交流之中。这两个区域之间的连接影响着我们的行为以及我们调节冲动和情绪的能力。当交流活动过于失衡，杏仁核的原始反应不受控制地占据主导地位时，麻烦就会出现。例如，科学家们发现焦虑跟杏仁核和前额叶皮质之间的连接微弱有关。没有前额叶皮质的监督，就像房间里没有大人，情绪不成熟的孩子会恣意妄为，无视规则、纪律和边界。