杏仁核又名杏仁体，有产生情绪和调节内脏活动的功能。
杏仁核位于侧脑室下角前端的上方，海马体旁回沟的外侧，顶部与尾状核的末端相连。它是边缘系统的一部分。
产生情绪
杏仁核判断所看见的物体在情绪上的重要性：猎物、天敌、还是配偶、无关紧要。如果杏仁核变得兴奋，那么说明眼前的东西很重要，神经信号就会向下发送到自主神经系统，心跳开始加速，手掌开始出汗（导致皮肤电阻改变），肌肉开始收缩。如果杏仁核判断看到的是无关紧要的东西，身体就没有上述反应。
杏仁核对恐惧情绪至关重要。杏仁核受损的人，不会感到恐惧。
杏仁核将某种刺激识别为危险时：它能让动物逃跑或者战斗。同时，它能产生情绪激励海马体，从而增强记忆。
杏仁核上也有多巴胺的受体。杏仁核将某种刺激识别为需要奖赏的体验时，海马体就会将该体验存储到记忆中，以便这种体验能够重复获得。
调节内脏活动
见 压力对身体的影响。
杏仁核与精神疾病
焦虑症，PTSD 对应的是杏仁核的过度激活。
前额叶和杏仁核是互相抑制的作用。前额叶可以控制杏仁核所发生的情绪反应。如果前额叶受损，导致对杏仁核的抑制能力下降，导致出现容易兴奋，狂躁。通过 正念冥想 可以加强对杏仁核的控制。